Marcos faz o seguinte, aí a consulta no banco será com in, e ele trará só aqueles que estão na lista:
List<int> ids =
new List<int>(){1, 2};
var varEmployee = from emin ef.Employee.AsQueryable()
where ids.Contains(em.EmployeeID)
selectnew
{
ID = em.EmployeeID,
SalesPerson = em.SalesPerson
};
Agora voê ganha de todas as maneiras :)